Hoy en día el programa cuenta con 715 Cátedras UNESCO y 69 Redes UNITWIN, en las que participan
- Cátedra UNESCO Universidad e integración regional (1995) del Instituto de Estudios sobre la Universidad, UNAM
- Cátedra UNESCO de Derechos Humanos (1996) de la Facultad de Ciencias Políticas y Sociales, UNAM
- Comunicación y Sociedad (1996) de la Universidad Iberoamericana
- Conservación de los Bienes Culturales (1997) de la Gestión del hábitat y desarrollo socialmente sustentable (1998) del Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Occidente (ITESO)
- Transformaciones económicas y sociales relacionadas con el problema internacional de las drogas (2000) del Instituto de Investigaciones Sociales, UNAM.
- Nuevas Tecnologías de Información (2001) de la Universidad de Colima
- Aseguramiento de la Calidad y Proveedores Emergentes de Educación Terciaria: de lo trasnacional a lo intercultural (2004) del Centro de Investigación y Estudios Avanzados (CINVESTAV) del Instituto Politécnico Nacional (IPN)
- Mujer, liderazgo y equidad (2007) de la Universidad de Guadalajara
- Cátedra “Bioética y la Medicina Clínica” (2007) UNAM
- Proyecto de Cátedra “El agua en la sociedad del conocimiento” (2008) del Instituto Mexicano de Tecnología del Agua
- Cátedra “Investigación sobre Patrimonio Cultural Intangible y Diversidad Cultural” del Centro Regional de Investigaciones Multidisciplinarias Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) Cátedra “Derechos Humanos y Ética” del ITESM – Cd. de México
- “Educación Intercultural para la Convivencia, la Cohesión Social y la Reconciliación en un Mundo Globalizado de la Universidad Autónoma del estado de Hidalgo
- Cátedra “Bioética